Сат Бесимбаевич Токпакбаев трудовую деятельность начал в июле 1956 года колхозником колхоза «Комсомол» Илийского района Алма-Атинской области, с августа 1957 — рабочий-вагонетчик Бурундайского кирпичного завода Алма-Атинской области, с сентября 1958 — студент Казахского Государственного университета.
С июля 1963 — следователь Алма-Атинской областной прокуратуры.
В 1964 году окончил Высшие курсы КГБ СССР в Минске.
Кадровый офицер Комитета государственной безопасности СССР. Прошёл путь от оперуполномоченного до начальника управления, член коллегии КГБ Казахской ССР.
С ноября 1991 — начальник управления КГБ Республики Казахстан по городу Алма-Ата и Алма-Атинской области.
С июня 1993 — первый заместитель председателя Комитета Национальной Безопасности Республики Казахстан.
С декабря 1993 — Председатель Комитета Национальной Безопасности Республики Казахстан.
С ноября 1995 — начальник службы охраны президента Республики Казахстан — командующий Республиканской гвардией.
С 1999 по 2001 год — министр обороны Республики Казахстан.
На протяжении ряда лет — член Совета Безопасности Республики Казахстан.
С декабря 2001 — советник президента Республики Казахстан — председатель Комиссии по вопросам гражданства при президенте Республики Казахстан — председатель Комиссии по борьбе с коррупцией и соблюдению служебной этики государственными служащими Республики Казахстан.
С сентября 2002 — председатель Совета Директоров авиакомпании ОАО «Евро-Азия-Эйр Интернэшнл».
С 2 сентября 2007 года — депутат Мажилиса Парламента Республики Казахстан, член Комитета по международным делам, обороне и безопасности.
Воинское звание — генерал-полковник (2001).